University of California-Berkeley

UC Berkeley Researchers Accelerate DNA Sequencing

Data storage performance improvements provide university researchers critical flexibility.

Summary

University of California-Berkeley researchers employ the latest tools built on Apache Spark to accelerate DNA sequencing in pursuit of precision medicine. Adding Pure FlashBlade™ from Pure Storage® has significantly reduced the time needed to sequence data-intensive DNA samples and analyze results.

Industry

  • Healthcare

GEO

  • North America

Use Cases

  • Data Analytics – Apache Spark®

Website

Challenges

The university had the following challenges before choosing Pure Storage.

  • Exponential increases in the volume of genomic data demanded new approaches to high-performance data storage. 
  • Needed to rethink the genome sequencing process.
  • Adding storage capacity required unacceptably large capital outlays and downtime.

Results

Business Transformation

Researchers and clinicians can sequence a greater volume of DNA samples in far less time, generating valuable new insights and, in some cases, delivering faster answers to life-and-death questions.

IT Transformation

  • Load times for a critical sequencing index accelerated by 3x.
  • Decoupling of storage from compute engines simplifies the addition of storage capacity, delivering agility needed for production workflow while lowering cost.
  • Multiple types of data workflows supported concurrently with no impact on performance, giving researchers critical flexibility to explore a broader range of questions.

En savoir plus

Étude de cas

Mercedes-AMG Petronas Motorsport remporte un avantage déloyal grâce à Pure Storage

Étude de cas

Man AHL réduit ses délais de mise sur le marché grâce au Data Hub Pure Storage

Étude de cas

Un bulletin de santé parfait pour le North York General Hospital

Étude de cas

Valley Proteins améliore la performance de SAP grâce à l’infrastructure convergée FlashStack

Étude de cas

SoftBank renforce ses performances et l’efficacité de ses opérations

Étude de cas

Les chercheurs de l’université de Californie à Berkeley accélèrent le séquençage de l’ADN

+
800-379-7873 +44 20 3870 2633 +43 720882474 +32 (0) 7 84 80 560 +33 9 75 18 86 78 +49 89 12089 253 +353 1 485 4307 +39 02 9475 9422 +31 (0) 20 201 49 65 +46-101 38 93 22 +45 2856 6610 +47 2195 4481 +351 210 006 108 +966112118066 +27 87551 7857 +34 51 889 8963 +41 31 52 80 624 +90 850 390 21 64 +971 4 5513176 +7 916 716 7308 +65 3158 0960 +603 2298 7123 +66 (0) 2624 0641 +84 43267 3630 +62 21235 84628 +852 3750 7835 +82 2 6001-3330 +886 2 8729 2111 +61 1800 983 289 +64 21 536 736 +55 11 2655-7370 +52 55 9171-1375 +56 2 2368-4581 +57 1 383-2387

Démarrer en trois étapes

1. Examiner vos exigences

Pour commencer, contactez nos experts pour qu’ils évaluent vos besoins en matière de stockage.

2. Réaliser une validation de principe

Réalisez une validation de principe avec notre équipe pour déterminer les solutions qui vous conviennent.

3. Migrer vers Pure

Associez-vous aux meilleurs spécialistes pour commencer à réduire votre coût total de possession (TCO).